wbg logo wbg logo

wbg logo

被子植物早期演化研究室

  1. 首页 > 
  2. 研究中心与研究团队 > 
  3. 特色农业资源植物研究中心 > 

本研究组聚焦于但不仅限于被子植物及主要大类群的早期分化支系（如睡莲目、毛茛目、山龙眼目、菖蒲目等），旨在通过追溯被子植物早期分化关键节点的基因组加倍、染色体重排等基因组演化事件，揭示被子植物及其主要大类群关键性状的起源、演化范式与基因调控网络机制。同时，解析这些早期分支类群中特有经济性状的演化途径与遗传基础，为相关类群的资源开发与利用提供科学依据。目前已发表SCI论文41篇，其中重要成果以第一或最后通讯作者发表在Science Advances、Nature Plants、Plant Cell、Genome Biology、Molecular Biology and Evolution、Plant Physiology、Plant Journal、Molecular Ecology、Journal of Integrative Plant Biology等期刊。

研究组长


 姓   名 石涛 学   历 博士
职   称 研究员 职   务 博士生导师, PI
通讯地址 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号
邮政编码 430074 电子邮箱 shitao323@wbgcas.cn
姓　名： 石涛
学 历： 博士
职 称： 研究员
职 务： 博士生导师, PI
通讯地址： 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号
邮政编码： 430074
电子邮箱： shitao323@wbgcas.cn
简要履历
2007年本科毕业于华中农业大学，2012年博士毕业于中国科学院大学/中国科学院武汉植物园。长期从事被子植物早期分支关键类群基因组演化与遗传学研究。相关成果以第一或最后通讯作者发表在Science Advances、Nature Plants、Plant Cell等高水平期刊。获得中国科学院青年促进会会员、湖北省青年拔尖人才、湖北省晨光计划、国家自然科学基金面上、青年项目及湖北省自然科学基金青年项目等资助。并受邀担任PNAS、MBE、New Phytologist、Plant Physiology、Plant Journal、Plant Biotechnology Journal等植物学领域重要期刊审稿人，以及Plants、Genes的专刊编辑、《Scientific Data》编委、《Plant Diversity》编委。

研究组科研项目

  • 湖北省青年拔尖人才培养计划，2024-01~2026-12，在研，主持（石涛）
  • 国家自然科学基金面上项目，32570276，2026-01~2029-12，主持（石涛）
  • 国家自然科学基金面上项目，32170240，主持（石涛）
  • 湖北省自然科学基金计划青年项目，024AFB314，2024-07~2027-03（高志妍）
  • 国家自然科学基金青年科学基金项目，31700197，主持（石涛）
  • 中国科学院青年创新促进会会员，2019335，2019-01~2022-12，主持（石涛）
  • 湖北省自然科学基金计划青年项目，2019CFB275，主持（石涛）

研究组代表成果

代表性论文：
  1. Shi T*, Van de Peer Y*. 2026 . Revisiting ancient whole-genome duplications in the seed and flowering plants through the lens of dosage-sensitive genes. Science Advances, 12:eaea9797.
  2. Shi T, Huneau C, Zhang Y, Li Y, Chen JM*, Salse J*, Wang QF*. 2022. The slow-evolving Acorus tatarinowii genome sheds light on ancestral monocot evolution. Nature Plants, 8: 764-777.
  3. Shi T#*, Gao ZY#, Chen JM, Van de Peer Y*. 2024. Dosage sensitivity shapes balanced expression and gene longevity of homoeologs after whole-genome duplications in angiosperms, The Plant Cell, 36(10): 4323–4337.
  4. Shi T*, Chen JM*. 2020. A reappraisal of the phylogenetic placement of the Aquilegia whole-genome duplication. Genome Biology, 21: 295.
  5. Shi T, Rahmani RS, Gugger PF, Wang MH, Li H, Zhang Y, Li ZZ, Wang QF*, Peer YVd*, Marchal K*, Chen JM*. 2020. Distinct expression and methylation patterns for genes with different fates following a single whole-genome duplication in flowering plants. Molecular Biology and Evolution, 37(8): 2394-2413.
  6. Gao ZY, Yang XY, Chen JM*, Rausher MD*, Shi T*. 2023. Expression inheritance and constraints on cis- and trans-regulatory mutations underlying lotus color variation. Plant Physiology, 191(3): 1662-1683.
  7. Zhang Y, Yang XY, Peer YVd, Chen JM*, Marchal K*, Shi T*. 2022. Evolution of isoform-level gene expression patterns across tissues during lotus species divergence. The Plant Journal, 112(3): 830-846.
  8. Shi T, Wang K, Yang PF*. 2017. The evolution of plant microRNAs-insights from a basal eudicot sacred lotus. The Plant Journal, 89(3): 442-457.
  9. Li H, Yang XY, Wang QF, Chen JM*, Shi T*. 2021. Distinct methylome patterns contribute to ecotypic differentiation in the growth of the storage organ of a flowering plant (sacred lotus). Molecular Ecology, 30:2831–2845.
  10. Li H, Yang XY, Zhang Y, Gao ZY, Liang YT, Chen JM*, Shi T*. 2021. Nelumbo genome database, an integrative resource for gene expression and variants of Nelumbo nucifera. Scientific Data, 8: 38.
其他论文详见https://www.researchgate.net/profile/Tao-Shi/research
专著：
  1. 《Underutilised Crop Genomes. Compendium of Plant Genomes》章节Advances and Prospects in Genomic and Functional Studies of the Aquatic Crop, Sacred Lotus，Springer, Cham出版社


 姓   名 高志妍 学  历 博士
职   务
职   称 助理研究员
通讯地址 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号
邮政编码 430074 电子邮箱 gaozhiyan@wbgcas.cn
姓　名： 高志妍
学 历： 博士
职 称： 助理研究员
职 务：
通讯地址： 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号
邮政编码： 430074
电子邮箱： gaozhiyan@wbgcas.cn
简要履历

2022年6月博士毕业于中国科学院武汉植物园，2023年2月入职武汉植物园。主要进行被子植物早期分支类群的微观演化与遗传学研究，重点关注莲属植物关键表型多样化（莲藕膨大、花色、花瓣瓣化等）的群体遗传和顺反式遗传变异调控规律与机制。相关研究成果以第一作者或共同作者发表于The Plant Cell、Plant Physiology、Plant Molecular Biology、Frontiers in Plant Science等期刊。