园艺植物基因组与分子改良研究组
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园艺植物基因组与分子改良研究组成立于2020年。课题组以番茄、猕猴桃等重要园艺作物为主要研究对象，基于基因组学前沿技术，着重阐释园艺作物进化、驯化过程中基因组多样性动态变化规律，解析关键农艺性状形成的分子机理，致力于园艺植物资源的高效开发利用，服务果蔬的分子改良和新品种创制。
研究组长
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姓 名 | 高磊 | 学 历 | 博士 |
| 职 称 | 研究员 | 职 务 | 博士生导师, PI | |
| 通讯地址 | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 | |||
| 邮政编码 | 430074 | 电子邮箱 | leigao@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 高磊 |
|---|---|
| 学 历： | 博士 |
| 职 称： | 研究员 |
| 职 务： | 博士生导师,PI |
| 通讯地址： | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 |
| 邮政编码： | 430074 |
| 电子邮箱： | leigao@wbgcas.cn |
简要履历
| 别于2003年和2006年获南京林业大学学士和硕士学位，2010年获得中国科学院研究生院博士学位，同年在武汉植物园参加工作，任助理研究员。2017-2020年于美国康奈尔大学Boyce Thompson Institute做博士后研究，2020年8月回到武汉植物园，组建学科组，任研究员。主要从事番茄等园艺植物基因组学研究，构建了第一个番茄泛基因组，发表了醋栗番茄、花椰菜、卷心菜等的高质量参考基因组，阐明了基因组结构变异在作物驯化和重要农艺性状形成中的重要作用。近年来，在Nature Genetics、Nature Communications、Plant Biotechnology Journal、BMC Biology等期刊发表论文十余篇。 |
获奖及荣誉
| 2014年 | 湖北省第十五届自然科学优秀学术论文一等奖 |
| 2015年 | “JSE Outstanding Papers”of Journal of Systematics and Evolution |
研究组科研项目
- 国家自然科学基金面上项目3项
- 国家自然科学基金青年项目2项
- 中国科学院高层次人才项目1项
- 湖北省自然科学基金创新群体项目1项
- 湖北省青年拔尖人才1人
- 武汉市武汉英才1人，武汉市晨光计划1项
研究组代表成果
代表性论文：
- Yu Zhao, Pan Wu, Yulin Huang, Sumin Guo, Xiaofen Yu, Donald Grierson, Lei Gao*, Shan Li. 2026. SlERF.F4 negatively regulates tomato fruit susceptibility to Botrytis cinerea independently of ripening traits. Postharvest Biology and Technology, 237:114286
- Enhui Lai, Sumin Guo, Pan Wu, Minghao Qu, Xiaofen Yu, Chenlu Hao, Shan Li, Haixu Peng, Yating Yi, Miao Zhou, Guodong Fu, Xingnuo Li, Huan Liu, Yi Zheng*, Xin Wang*, Zhangjun Fei*, Lei Gao*. 2025. Genome of root celery and population genomic analysis reveal the complex breeding history of celery. Plant Biotechnology Journal, 23: 946-959.
- Shan Li, Yulin Huang, Yu Zhao, Pan Wu, Sumin Guo, Xiaofen Yu, Benzhong Zhu, Kunsong Chen*, Donald Grierson*, Lei Gao*. 2025. Ripening-induced defence signalling in Botrytis cinerea-infected tomato fruits involves activation of ERF.F4 by a MYC2-NOR/RIN protein complex. Plant Biotechnology Journal, 23: 4126-4139.
- Xiaofen Yu, Minghao Qu, Pan Wu, Miao Zhou, Enhui Lai, Huan Liu, Sumin Guo, Shan Li, Xiaohong Yao*, Lei Gao*. 2025. Super pan-genome reveals extensive genomic variations associated with phenotypic divergence in Actinidia. Molecular Horticulture, 5: 4.
- Xiangrong Fan, Minghao Qu, Nancy Rybicki, Lynde L. Dodd, Jie Min, Yuanyuan Chen, Lei Gao*. 2025. Genomic resequencing unravels species differentiation and polyploid origins in the aquatic plant genus Trapa. The Plant Journal，123: e70463
- Shan Li, Yu Zhao, Pan Wu, Donald Grierson*, Lei Gao*. 2024. Ripening and rot: How ripening processes influence disease susceptibility in fleshy fruits. Journal of Integrative Plant Biology， 66: 1831–1863.
- Xue-Mei Lu, Xiao-Fen Yu, Guo-Qiang Li, Ming-Hao Qu, Huan Wang, Chuang Liu, Yu-Ping Man, Xiao-Han Jiang, Mu-Zi Li, Jian Wang, Qi-Qi Chen, Rui Lei, Cheng-Cheng Zhao, Yun-Qiu Zhou, Zheng-Wang Jiang, Zuo-Zhou Li, Shang Zheng, Chang Dong, Bai-Lin Wang, Yan-Xiang Sun, Hui-Qin Zhang, Jie-Wei Li, Quan-Hui Mo, Ying Zhang, Xin Lou, Hai-Xu Peng, Ya-Ting Yi, He-Xin Wang, Xiu-Jun Zhang, Yi-Bo Wang, Dan Wang, Li Li, Qiong Zhang, Wen-Xia Wang, Yongbo Liu*, Lei Gao*, Jin-Hu Wu*, Yan-Chang Wang*. 2024. Genome assembly of autotetraploid Actinidia arguta highlights adaptive evolution and enables dissection of important economic traits. Plant Communications， 5: 100856.
- Pan Wu, Shan Li, Xiaofen Yu, Sumin Guo, Lei Gao*. 2024. Identification of long-chain acyl-CoA synthetase gene family reveals that SlLACS1 is essential for cuticular wax biosynthesis in tomato. International Journal of Biological Macromolecules， 277: 134438.
- Xiaofen Yu, Mengyun Qin, Minghao Qu, Quan Jiang, Sumin Guo, Zhenghai Chen, Yufang Shen, Guodong Fu, Zhangjun Fei, Hongwen Huang*, Lei Gao*, Xiaohong Yao*. 2023. Genomic analyses reveal dead-end hybridization between two deeply divergent kiwifruit species rather than homoploid hybrid speciation. The Plant Journal， 115: 1528-1543.
- Xiaofen Yu, Minghao Qu, Yanna Shi, Chenlu Hao, Sumin Guo*, Zhangjun Fei*, Lei Gao*. 2022. Chromosome-scale genome assemblies of wild tomato relatives Solanum habrochaites and Solanum galapagense reveal structural variants associated with stress tolerance and terpene biosynthesis. Horticulture Research， 9: uhac139.
- Ning Guo, Shenyun Wang, Lei Gao, Yongming Liu, Xin Wang, Enhui Lai, Mengmeng Duan, Guixiang Wang, Jingjing Li, Meng Yang, Mei Zong, Shuo Han, Yanzheng Pei, Theo Borm, Honghe Sun, Liming Miao, Di Liu, Fangwei Yu, Wei Zhang, Heliang Ji, Chaohui Zhu, Yong Xu, Guusje Bonnema*, Jianbin Li*, Zhangjun Fei*, Fan Liu*. 2021. Genome sequencing sheds light on the contribution of structural variants to Brassica oleracea diversification. BMC Biology， 19: 93.
- Hui Zhou, Ruijuan Ma, Lei Gao, Jinyun Zhang, Aidi Zhang, Xiujun Zhang, Fei Ren, Weihan Zhang, Liao Liao, Qiurui Yang, Shengli Xu, Collins Otieno Ogutu, Jianbo Zhao, Mingliang Yu, Quan Jiang, Schuyler S. Korban, Yuepeng Han*. 2021. A 1.7-Mb chromosomal inversion downstream of a PpOFP1 gene is responsible for flat fruit shape in peach. Plant Biotechnology Journal， 19: 192-205.
- Xin Wang, Lei Gao, Chen Jiao, Stefanos Stravoravdis, Prashant S. Hosmani, Surya Saha, Jing Zhang, Samantha Mainiero, Susan R. Strickler, Carmen Catala, Gregory B. Martin, Lukas A. Mueller, Julia Vrebalov, James J. Giovannoni, Shan Wu*, Zhangjun Fei*. 2020. Genome of Solanum pimpinellifolium provides insights into structural variants during tomato breeding. Nat. Commun，11: 5817.
- Lei Gao, Itay Gonda, Honghe Sun, Qiyue Ma, Kan Bao, Denise M. Tieman, Elizabeth A. Burzynski-Chang, Tara L. Fish, Kaitlin A. Stromberg, Gavin L. Sacks, Theodore W. Thannhauser, Majid R. Foolad, Maria Jose Diez, Jose Blanca, Joaquin Canizares, Yimin Xu, Esther van der Knaap, Sanwen Huang, Harry J. Klee, James J. Giovannoni*, Zhangjun Fei*. 2019. The tomato pan-genome uncovers new genes and a rare allele regulating fruit flavor. Nature Genetics，51: 1044-1051.
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姓 名 | 李珊 | 学 历 | 博士 |
| 职 称 | 研究员 | 职 务 | 硕士生导师 | |
| 通讯地址 | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 | |||
| 邮政编码 | 430074 | 电子邮箱 | lishan@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 李珊 |
|---|---|
| 学 历： | 博士 |
| 职 称： | 研究员 |
| 职 务： | 硕士生导师 |
| 通讯地址： | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 |
| 邮政编码： | 430074 |
| 电子邮箱： | lishan@wbgcas.cn |
简要履历
2017年毕业于中国农业大学，获博士学位。2017-2019年在浙江大学进行博士后研究，2019-2021年在浙江大学任特聘副研究员。2021年12月进入中国科学院武汉植物园工作，主要从事番茄成熟和抗病基因挖掘和功能鉴定。以第一作者和通讯作者在New Phytologist、Plant Physiology、BMC Genomics、Food Quality and Safety和Cells期刊发表文章6篇，并参与发表SCI多篇。主持国家自然科学基金青年项目、浙江省自然科学基金、中国博士后科学基金、浙江大学青年科研创新专项等项目，并参与国家重点研发计划和国家自然科学基金面上项目等多项科研项目。
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姓 名 | 於晓芬 | 学 历 | 博士 |
| 职 称 | 职 务 | 特别研究助理 | ||
| 通讯地址 | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 | |||
| 邮政编码 | 430074 | 电子邮箱 | yuxiaofen@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 於晓芬 |
|---|---|
| 学 历： | 博士 |
| 职 称： | |
| 职 务： | 特别研究助理 |
| 通讯地址： | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 |
| 邮政编码： | 430074 |
| 电子邮箱： | yuxiaofen@wbgcas.cn |
简要履历
2020年毕业于华中科技大学，获博士学位。同年，加入华大智造科技有限公司，任生物技术研究员。2021年7月进入中国科学院武汉植物园工作，主要以番茄等重要蔬菜水果为研究对象，通过基因组学、转录组学等手段，解析果实品质、抗病性等关键农艺性状形成的分子途径和机理，致力于果蔬的分子改良和新品种创制。以第一作者在Plant Cell Reports、International Journal of Molecular Sciences、Frontiers in Plant Science等杂志发表SCI论文4篇。
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姓 名 | 吴攀 | 学 历 | 博士 |
| 职 称 | 职 务 | 特别研究助理 | ||
| 通讯地址 | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 | |||
| 邮政编码 | 430074 | 电子邮箱 | wupan@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 吴攀 |
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| 学 历： | 博士 |
| 职 称： | |
| 职 务： | 特别研究助理 |
| 通讯地址： | 武汉市东湖新技术开发区九峰一路201号 |
| 邮政编码： | 430074 |
| 电子邮箱： | wupan@wbgcas.cn |
简要履历
2019年毕业于中国科学院大学，获博士学位。2019-2021年在湖北大学生命科学学院从事博士后研究。2021年12月进入中国科学院武汉植物园工作。研究方向为植物脂质的合成和调控分子机制研究，目前主要从事番茄果实角质层生物合成和调控关键基因的发掘工作，并探讨这些关键基因对番茄果实色泽、硬度和货架期等采后品质的影响。近年来，在Plant Physiology and Biochemistry、International Journal of Molecular Sciences、BMC Plant Biology和The Plant Journal等杂志发表论文4篇。
