莲是我国重要的水生经济作物，包含温带型和热带型两种主要生态类型，在我国南北方均有分布。其地下茎俗称为藕，是一种重要的水生蔬菜。通常温带型莲的地下茎会膨大成藕，而热带型莲的地下茎不能
膨大成藕。在育种生产过程中，将温带莲和热带莲分别互换生长环境，它们的地下茎仍然保持其在原产地的膨大特点。由此可见，莲的地下茎膨大是受遗传物质所控制的。因此开展莲的膨大机理研究，不仅可以从分子生物学层面解释不同品种的莲藕的膨大机理，而且还可以应用这些研究结果为莲藕的增产提供理论依据。
水生植物基因组学与遗传育种学科组杨美副研究员在杨平仿研究员的指导下，利用转录组测序技术深入分析了温带莲(ZO) 和热带莲(RL) 两个品种的地下茎在不同生长阶段的基因的表达。通过深入分析差异基因的表达情况，发现大量差异表达的基因属于碳水化合物代谢途径和植物激素信号传导途径。该研究结果为进一步揭示莲藕地下茎膨大机理奠定了坚实的基础，相关研究结果已在线发表于Scientific Reports 杂志。
温带莲和热带莲的地下茎发育状态
参与植物激素信号传导的差异表达基因
