海洋药物的应用由来已久，并在临床应用中表现出独特的优势。在已获FDA批准的海洋药物中，蛋白-配体的相互作用，如阿糖胞苷-DNA聚合酶、腺苷环化酶和川芎嗪-微管蛋白复合物是其发挥功效的重要作用机制。然而，海洋药用资源中由于成分复杂、靶点各异，其发挥生物活性的化学基础和作用机制仍然难以揭示，对海洋药物的发现和研发提出了巨大的挑战，因而需要采用新的方法和技术进行更系统深入研究。分子对接（Molecular Docking）可以有效地预测蛋白配体复合物的结合模式和结合能，已成为计算机辅助药物设计（CADD）的主要方法，有望在海洋药物研究的许多方面发挥出重要作用。
基于上述研究背景，中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室、武汉植物园植物化学生物学学科组副研究员陈桂林、博后Armel Jackson Seukep在郭明全研究员的指导下，较为系统介绍了分子对接的基本原理和软件，并进一步阐释了分子对接在海洋药物发现与设计中的可能应用，包括药物发现阶段的早期虚拟筛选、药物靶标发现、药物潜在作用机制以及药物代谢产物预测等。此外，论文还对分子对接在海洋药物研发方面存在的问题进行了讨论和展望，以期为海洋新药的研究开发和临床实践提供更多的理论依据。
相关成果以“Recent Advances in Molecular Docking for the Research and Discovery of Potential Marine Drugs”为题，发表在药物化学领域JCR TOP 30%国际学术期刊Marine Drugs上。该工作得到了国家自然科学基金（81673580、81903791）、中国科学院青年创新促进会（2020337）和湖北省自然科学基金（2019CFB254）的资助。
文章链接：https://www.mdpi.com/1660-3397/18/11/545
图1. 分子对接类型：a 锁-钥匙模型；b诱导-拟合理论。
