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研究进展

武汉植物园在金豆的叶绿体全基因组解析取得新研究进展

  金豆(Fortunella venosa (Champ. ex Benth.) C.C.Huang)是芸香科中一种多年生常绿灌木。此物种为我国特有,分布区域与金柑(中国植物志:Fortunella hindsii (Champ. ex Hook.) Swingle)略有重叠,且范围狭窄,主要分布在福建南平和江西永丰等地,近期在湖南宁远、茶陵和桂东等地也有发现。由于气候变化和人类活动影响等原因,该种在野外存在数量已经大幅度减少,因此作为濒危物种被列入《中国物种红色名录(红色名录第1卷)》。此外,该种在分类学和系统学上的地位素有争议。在英文版中国植物志(Flora of China)中,金橘属(中国植物志:Fortunella Swingle)被并入柑橘属(Citrus L.),原金橘属中包括金豆在内的几个物种都被处理为金柑(Flora of ChinaCitrus japonica Thunb.)的同物异名。 

  湖南师范大学生命科学学院的研究人员与中国科学院武汉植物园东非植物区系与分类学科组合作,对采自湖南株洲地区金豆的叶绿体全基因组进行了测序和分析,并与金柑进行了分子和形态上的比较分析。 

  金豆的叶绿体基因组大小为160,265 bp,具典型的被子植物环状四分体结构,包括一个大单拷贝区(LSC)(87,597 bp)、一个小单拷贝区(SSC)(18,732 bp)和一对反向重复区(IRa\IRb)(每个26,968 bp)。叶绿体基因组中有134个预测基因,包括89个蛋白质编码基因、8rRNA37tRNA(图1.)。 

  基于叶绿体基因组序列数据的系统发育分析结果(图2和图3)表明,金橘属与金柑属亲缘关系密切,但不支持金豆与金柑的合并,它们应当处理为两个不同的物种,金豆独立成种的地位得到强烈支持,其与金柑在形态(生活型、叶型、果实大小等)上存在显著差异。金豆为小灌木,通常高不超过1米(最矮的成熟植株高仅0.28米);叶为单叶(叶柄与叶片接合处无关节);叶小,长2–4(7)厘米,宽1–2厘米,基部楔形;叶柄短,长1–3(5)毫米;花单生叶腋,花瓣3–5毫米长;子房2–3室;果球形或椭圆形,直径6–8毫米,成熟时橙红色。而金柑为小乔木或乔木,高2–8.5米,主茎细长;叶为单身复叶(叶柄和叶片接合处具关节);叶较大,长4–9厘米,宽1.5–3.5厘米,基部宽楔形;叶柄明显较长,长6–10(15) 毫米;花单生或2–3朵簇生叶腋,花瓣长6–8毫米;子房4–6室;果实较大,呈球形,直径1.5–2.5厘米,熟后呈橙黄色至橙红色(图4)。 

  本研究以“Complete Chloroplast Genome Sequence of Fortunella venosa (Champ. ex Benth.) C.C.Huang (Rutaceae): Comparative Analysis, Phylogenetic Relationships, and Robust Support for Its Status as an Independent Specie”为题发表在国际林学期刊Forests上。本研究得到了国家科技基础资源调查专项(2019FY101800)、湖南省林木种质资源调查项目(湘才农志(2015)91)和中国科学院国际合作项目(151853KYSB20190027)等项目的支持。湖南师范大学生命科学学院的硕士研究生王婷为本文的第一作者,胡光万研究员及蔡秀珍博士为通讯作者。 

1:金豆(Fortunella venosa (Champ. ex Benth.) C.C.Huang)叶绿体基因组基因图谱。 

2 27种芸香科植物的CDS系统发育树 

3:基于叶绿体全基因组序列的27种芸香科植物BI系统发育树 

4:金柑和金豆的主要形态结构比较 A金柑 B金豆 1.植株及生境 2.枝条 3. 4. 5.果枝 6.果实及果实横切 

 
东非植物区系与分类学科组 Vincent Okelo Wanga,孔珊珊