园艺保育中心主要承担武汉植物园的植物引种、驯化与保育管理，植物专类园建设，园区景观建设与维护等业务工作。现有职工24人，其中博士6人，硕士9人，本科9人；具有高级专业技术职称9人，中级专业技术职称14人，初级专业技术职称1人。近年来，累计发表植物新种23个，编写专著24部，授权专利15个，培育新品种200余个，承担制定省地方标准2个。
十四五期间，将立足华中，辐射一带一路，收集全球亚热带和暖温带战略植物资源，基本实现湖北和华中珍稀濒危植物全覆盖，强化水生植物、药用植物、专科植物保育特色，创建3-5个国家级种质资源圃保育平台。规范园区管理，打造精品示范区，提高专类园科学内涵和园林园艺展示水平，凸显地域植物和专类植物特色，建设国际知名专类园2-3个。
刘艳玲，园艺保育中心主任。统筹安排园艺保育中心的整体工作，分管专类园建设，园区景观建设与维护，国家植物园体系建设，以及园区安全等。
卢志军，园艺保育中心副主任。分管植物引种、驯化与保育管理。
光谷园区：占地面积为1103亩，功能定位为针对性收集保育重要生物经济资源，建设特色农业植物新品种、新成果展示示范基地，成为以生物多样性保护为主，集科研及成果展示、科普与观光休闲为一体的高标准、高起点的生物多样性保护区与科研成果孵化示范区。
磨山园区：占地面积为886亩，功能定位为国家植物资源储备和植物迁地保护的综合研究基地，现收集保育植物资源13000余种，建有世界上涵盖遗传资源最广的猕猴桃专类园、东亚最大的水生植物专类园、华中最大的野生果树专类园、华中古老孑遗和特有珍稀植物专类园、华中药用植物专类园等17个特色专类园。
引种保育圃：占地面积为40亩，功能定位为引种植物迁地保育第一站，野外采集、交换或购买的不同来源植物资源首先定植于保育圃，并开展物候、越冬、越夏、抗性等适应性观测研究和适应性评价。经3-5年驯化栽培成功后，移栽于主园区定植。
